researchJobsPostdoc in Bioinformatics and Cancer Genetics
Postdoktor i bioinformatik och cancergenetik — Machine-translated title
From the ad
The University of Gothenburg meets society's challenges with diverse knowledge. 58 000 students and 6800 employees make the university a large and inspiring workplace. Strong research and attractive education attracts researchers and students from all over the world. With new knowledge and new perspectives, the University of Gothenburg contributes to a better future.
Subject
Bioinformatics and cancer genetics
Substance description
Somatic mutation accumulation and clonic evolution are central processes in cancer development. Through large-scale weekend resequencing and large-scale methods, these processes can be mapped in detail, providing insights into tumour initiation, progression and treatment response.
This service focuses on the development and application of bioinformatics methods for analysis of genomic cancer data, including large public international datasets and locally generated patient-related sequencing data. The project includes studies of somatic mutation processes, clonic dynamics, tumour development history or integrative analyses of genomic and clinical data. Analyses of non-cancer-related sequencing data may also be considered.
The work takes place in a research environment with strong competence in cancer genomics, computational biology and translational research.
Recent work published by the group includes:
Ögren et al., Light-based footprinting of a eukaryotic genome. Science Advances 2026; Elliott et al., Mechanical basis of atypical TERT promoter mutations.Nature Communications 2024; Elliott et al. Base Resolution UV footprinting by sequential reveals distinctive damage signatures for DNA binding proteins. Nature Communications. 2023; Boström et al. Somatic mutation distribution across tumor cohorts provides a signal for positive selection in cancer. Nature Communications. 2022; Elias et al. Independent somatic evolution supports clustered neuroendocrine tumors in the human small intestinal. Nature Communications. 2021; Van den Eynden et al. Lacquer of detectable neoantigen depletion signals in the untreated cancer genome. Nature Genetics. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2019.
Tasks
The postdoctoral researcher will apply and develop bioinformatics methods for analysis of weekend resequencing and other NGS-based data from patients, such as mutation calling and detection of mosaic mutations. The work may also include statistical analyses and visualisation to identify and interpret somatic mutation patterns and other genomic changes, as well as integration of genomic data with clinical and phenotypic variables when relevant. The researcher is expected to contribute to manuscript writing and publication in international scientific journals, and may present research results at national and international conferences.
Jurisdiction
Qualities for employment as a teacher are regulated in the Higher Education Ordinance 4 Cape and the University of Gothenburg's employment scheme.
Qualifying to be employed as a postdoc is the person who has completed a doctoral degree, an artistic doctorate or who has a foreign degree that is considered equivalent to a doctoral degree.
In the first instance, the person who has completed the degree should be considered not more than three years before the end of the application period. The former graduates should also be considered first, if there are special reasons. Special reasons refer to leave due to illness, parental leave, positions of trust in trade unions, service in total defence, or other similar circumstances, as well as clinical service or for the subject area of relevant duty/missions.
Assessment basis
Good programming skills and experience with linux/unix is a requirement. Knowledge in R or Matlab is also very desirable. Previous experience in analysis of large-scale sequencing data is recommended, especially knowledge in mapping of somatic mutations. Experience from relevant biological areas is desirable and the applicant is expected to have published several peer reviewed scientific articles. Excellent communicative skills are required, including fluent English in speech and writing.
Assessment criteria for employment as a teacher are listed in 4 chapter 3 – 4 § Higher Education Ordinance and the Gothenburg University's own employment scheme.
Employment
The employment is full-time and limited-term, two years with the possibility of a one-year extension, with the position until further notice at the Department of Biomedicine. Access is by agreement.
Appointment procedure
Contact details of the employment
Information about the position is provided by: Erik Larsson Lekholm, Professor, phone: +46 31 786 6942, e-mail: erik.lekholm@gu.se.
Trade unions
Trade union representatives at Götebrg University can be found here: https://www.gu.se/jobba-hos-goteborgs-universitet/sa-blir-du-en-av-oss#kollektivavtal-och-fackliga-foretradare
Application procedure
You can apply for the position via the University of Gothenburg's recruitment portal by clicking the "Apply" button. As an applicant, you are responsible for ensuring that the application is complete in accordance with the advertisement and that it reaches the universality no later than the closing date for the application.
The application shall contain:
- A personal letter stating why you are applying for the service
- CV including scientific publications
- Two references with contact details
- Copy of certificate of doctoral degree
The application must be submitted by:: 2026-10-10
The University works actively for a work environment with equal conditions and values the qualities diversity brings to the business. The university applies individual salary setting. According to the regulations of the National Archives, the University is obliged to keep application documents for two years after the appointment decision. If you, as an applicant for employment, specifically request your documents back, they will be returned after the two years have elapsed, otherwise they will be eliminated. To staffing and recruitment companies and to those who are sellers: The University of Gothenburg hires a procured advertising agency in connection with the recruitment of staff. We kindly object to direct contact with staffing and recruitment companies as well as sales of job ads.
Machine translation (OPUS-MT) — the original text is authoritative
Show the original advertisement
Göteborgs universitet möter samhällets utmaningar med mångsidig kunskap. 58 000 studenter och 6800 medarbetare gör universitetet till en stor och inspirerande arbetsplats. Stark forskning och attraktiva utbildningar lockar forskare och studenter från hela världen. Med ny kunskap och nya perspektiv bidrar Göteborgs universitet till en bättre framtid.
Ämne
Bioinformatik och cancergenetik
Ämnesbeskrivning
Somatisk mutationsackumulering och klonal evolution är centrala processer i cancerutveckling. Genom storskalig helgenomsekvensering och storskaliga metoder kan dessa processer kartläggas i detalj, vilket ger insikter i tumörinitiering, progression och behandlingsrespons.
Denna tjänst fokuserar på utveckling och tillämpning av bioinformatiska metoder för analys av genomiska cancerdata, inklusive stora publika internationella dataset och lokalt genererade patientnära sekvenseringsdata. Projektet omfattar studier av somatiska mutationsprocesser, klonal dynamik, tumörers utvecklingshistoria eller integrativa analyser av genomiska och kliniska data. Analyser av icke-cancerrelaterade sekvenseringsdata kan också komma i fråga.
Arbetet sker i en forskningsmiljö med stark kompetens inom cancergenomik, beräkningsbiologi och translationell forskning.
Arbeten publicerade av gruppen under senare tid inkluderar:
Ögren et al., Light-based footprinting of a eukaryotic genome. Science Advances 2026; Elliott et al., Mechanistic basis of atypical TERT promoter mutations. Nature Communications. 2024; Elliott et al. Base-resolution UV footprinting by sequencing reveals distinctive damage signatures for DNA-binding proteins. Nature Communications. 2023; Boström et al. Somatic mutation distribution across tumour cohorts provides a signal for positive selection in cancer. Nature Communications. 2022; Elias et al. Independent somatic evolution underlies clustered neuroendocrine tumors in the human small intestine. Nature Communications. 2021; Van den Eynden et al. Lack of detectable neoantigen depletion signals in the untreated cancer genome. Nature Genetics. 2019.
Arbetsuppgifter
Den postdoktorala forskaren kommer att tillämpa och utveckla bioinformatiska metoder för analys av helgenomsekvensering och andra NGS-baserade data från patienter, så som mutationscalling och detektion av mosaikmutationer. Arbetet kan också innefatta statistiska analyser och visualisering för att identifiera och tolka somatiska mutationsmönster och andra genomiska förändringar, samt integration av genomiska data med kliniska och fenotypiska variabler när så är relevant. Forskaren förväntas bidra till manuskriptförfattande och publicering i internationella vetenskapliga tidskrifter, och kan komma att presentera forskningsresultat vid nationella och internationella konferenser.
Behörighet
Behörighet för anställning som lärare regleras i Högskoleförordningen 4 Kap och Göteborgs universitets anställningsordning.
Behörig att anställas som postdoktor är den som har avlagt doktorsexamen, konstnärlig doktorsexamen eller som har en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen.
I första hand bör den komma i fråga som har avlagt examen högst tre år före ansökningstidens utgång. Även den som avlagt examen tidigare bör komma i fråga i första hand, om det finns särskilda skäl. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, tjänstgöring inom totalförsvaret, eller andra liknande omständigheter samt klinisk tjänstgöring eller för ämnesområdet relevant tjänstgöring/uppdrag.
Bedömningsgrund
Goda programmeringskunskaper och erfarenhet av linux/unix är ett krav. Kunskaper i R eller Matlab är också mycket önskvärt. Tidigare erfarenhet av analys av storskalig sekvenseringsdata rekommenderas, särskilt kunskaper inom mappning av somatiska mutationer. Erfarenhet från relevanta biologiska områden är önskvärt, och den sökande förväntas ha publicerat flera referentgranskade vetenskapliga artiklar. Utmärkta kommunikativa färdigheter krävs, inklusive flytande engelska i tal och skrift.
Bedömningsgrunder vid anställning som lärare finns angivna i 4 kap 3 – 4 § högskoleförordningen samt Göteborgs universitets egen anställningsordning.
Anställning
Anställningen är på heltid och tidsbegränsad, två år med möjlighet till ett års förlängning, med placering tills vidare på institutionen för biomedicin. Tillträde sker enligt överenskommelse.
Tillsättningsförfarande
Kontaktuppgifter för anställningen
Upplysningar om anställningen lämnas av: Erik Larsson Lekholm, Professor, phone: +46 31 786 6942, e-mail: erik.lekholm@gu.se.
Fackliga organisationer
Fackliga företrädare vid Götebrgs universitet hittar du här: https://www.gu.se/jobba-hos-goteborgs-universitet/sa-blir-du-en-av-oss#kollektivavtal-och-fackliga-foretradare
Ansökningsförfarande
Du söker anställningen via Göteborgs universitets rekryteringsportal genom att klicka på knappen "Ansök". Du som sökande ansvarar för att ansäkan är komplett i enlighet med annonsen och att den är univversitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.
Ansökan ska innehålla:
- Ett personligt brev med motivering till varför du söker tjänsten
- CV som inkluderar vetenskapliga publikationer
- Två referenser med kontaktuppgifter
- Kopia på bevis för doktorsexamen
Ansökan ska vara inkommen senast: 2026-10-10
Universitetet arbetar aktivt för en arbetsmiljö med jämställda förhållanden och sätter värde på de kvalitéer mångfald tillför verksamheten. Universitetet tillämpar individuell lönesättning. Enligt Riksarkivets föreskrifter är universitetet skyldigt att förvara ansökningshandlingar i två år efter tillsättningsbeslutet. Om du som sökande till en anställning särskilt begär tillbaka dina handlingar återsänds de när de två åren har förflutit, i annat fall kommer de att gallras ut. Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Göteborgs universitet anlitar upphandlad annonsbyrå i samband med rekrytering av personal. Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av jobbannonser.
Advertisement text from Arbetsförmedlingen / Platsbanken (JobTech), Creative Commons CC0 (public domain dedication).
The employer's ad is the binding version. Apply through their system.
?
Saved calls and ads appear on your calendar, and their deadlines are included when you export it. Nothing else is added for you.