Doctoral Researcher in Interferometric Imaging of the Eye in Transmission (m/f)

Description du Poste

Sujet De Thèse

Le projet vise à développer une nouvelle technologie d'imagerie ophtalmique, la tomographie optique en transmission 4D (4D-OTT), capable de visualiser in vivo, en 3D et au cours du temps, les cellules immunitaires et les nerfs de la cornée humaine. L'enjeu est de caractériser quantitativement l'état inflammatoire de la surface oculaire, impliqué dans de nombreuses pathologies courantes (sécheresse oculaire, kératites, inflammation post-chirurgicale, rejet de greffe).
Le doctorant partira de la microscopie interférométrique en transmission (TIM) développée au laboratoire et récemment publiée dans Nature Communications, puis l'étendra selon trois axes : amélioration du contraste et sectionnement tomographique par contrôle de la phase (approche de type contraste de phase) ; imagerie volumétrique et dynamique de l'œil en mouvement ; traitement des données par réseaux de neurones (débruitage, segmentation) et extraction de biomarqueurs quantitatifs statiques et dynamiques.
Le dispositif sera ensuite transféré en milieu clinique pour une étude sur sujets sains et patients, en collaboration avec l'Hôpital National des Quinze-Vingts et l'Institut de la Vision.
Profil recherché : Master ou diplôme d'ingénieur en optique, physique, photonique ou ingénierie biomédicale. Compétences en optique expérimentale, idéalement avec une expérience pratique de l'interférométrie. Programmation : maîtrise pratique de Python ou C/C++, gestion des environnements de développement et des versions (Git/GitLab). Instrumentation : expérience pratique du contrôle et de la synchronisation de dispositifs (Arduino, LabVIEW/National Instruments). Des connaissances en réseaux de neurones (architectures de type U-Net) sont bienvenues. Intérêt pour l'instrumentation, le traitement d'images et le travail interdisciplinaire avec des cliniciens et des biologistes. Maîtrise de l'anglais scientifique.

Votre Environnement de Travail

Le doctorant sera accueilli à l'Institut Langevin (UMR7587, CNRS / ESPCI Paris-PSL / Sorbonne Université / Université Paris Cité), laboratoire de renommée internationale en physique des ondes et imagerie biomédicale, situé au cœur de Paris (1 rue Jussieu, 75005).
La thèse s'inscrit dans le projet de recherche 4D-OTT, à l'interface entre optique instrumentale, traitement de données et recherche clinique. Le doctorant disposera d'un laboratoire d'optique équipé, d'un atelier de mécanique et de moyens de calcul, et travaillera au sein d'une équipe pluridisciplinaire. Le projet repose sur des collaborations établies avec l'Hôpital National des Quinze-Vingts et l'Institut de la Vision (Paris), où le prototype sera évalué sur sujets humains et, en parallèle, adapté à des modèles murins.
La thèse offre un environnement favorable à la valorisation (dépôts de brevets, transfert industriel) et à la participation à des conférences internationales.

Contraintes et risques

Utilisation de sources lumineuses (LED et lasers de faible puissance) dans le respect des règles de sécurité optique en vigueur au laboratoire ; les niveaux d'exposition oculaire sont mesurés et conformes aux normes applicables aux dispositifs ophtalmiques.
Déplacements réguliers sur les sites partenaires parisiens (Hôpital National des Quinze-Vingts, Institut de la Vision) pour les campagnes de mesure, avec participation à des séances d'imagerie sur volontaires sains et patients, ce qui implique des horaires adaptés à l'activité hospitalière.

Rémunération et avantages

Rémunération

La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel

Congés et RTT annuels

44 jours

Pratique et Indemnisation du TT

Pratique et indemnisation du TT

Transport

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€

À propos de l’offre

Référence de l’offre UMR7587-VIAMAZ-002 Section(s) CN / Domaine de recherche Pharmacologie - ingénierie et technologies pour la santé - imagerie biomédicale

À propos du CNRS

Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.

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