researchJobsDoctoral Researcher in Biophysics of DNA-Azobenzene Complexes (m/f)
Doctorant en biophysique des complexes ADN-azobenzene (H/F) — Machine-translated title
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Description of the post
Subject of Thesis
The diffusion and diffraction methods of time-resolved X-rays have revolutionized structural biology, highlighting the structural dynamics that accompany essential biological functions. The doctoral student will use the static and time-resolved diffusion of X-rays in solution to track the structural changes of photowitches based on azobenzene-G-quadruplex (AzO-G4) DNA after light excitation, thus revealing the volume variations induced by photoisomerization of the azobenzene and providing insight into the dynamics and structural hierarchy of conformational changes in the AzO-G4.
Your Working Environment
Located on the Scientific Polygon of Grenoble (ESRF/ILL/EMBL/IBS), the Institute of Structural Biology (IBS) is a national and international player in the field of integrated structural biology. At the same time a research centre, a technical platform, a site of reception and scientific training, the IBS has as its purpose the development of research in structural biology, a field of research which is crucial for the understanding of fundamental biological mechanisms. It relies on 12 state-of-the-art platforms.
As a joint research unit (CEA-CNRS-UGA) the IBS is composed of 20 research groups, each of which proposes a multidisciplinary approach, at the boundaries of biology, physics and chemistry, consistent with 3 research axes. Nearly 320 people work there: researchers, PhD students, engineers and technicians in a multicultural and international environment.
The recruit will join the Dynamop group, which focuses on studying the structural dynamics of biological macromolecules:
https://www.ibs.fr/en/research/assembly-dynamics-and-reactivity/dynamics-and-kinetics-of-molecular-processes-group-m-weik/?lang=en
Activities:
- Prepare samples of AzO-G4 in solution
- Participate in time-resolved X-ray diffusion experiments
- Analyze and interpret experimental data
- Model experimental data using molecular dynamics simulations
- Format results for reports and oral presentations in English
- To be the driving force for the development and improvement of experiments
- Write protocols and research articles in English for the publication of the work carried out
- Participate in the joint life of the research group
- Assist in the supervision of trainees
- Participate in the Institute's scientific events
Competences:
- skills in biophysics or physics of soft matter
- notions of biochemistry of biological molecules
- mastery of experimental data analysis tools
- knowledge of a programming language (Python, C++, etc.)
- English (written/oral) level B2
- Capacity for autonomy
- Pro-activity in research, scientific curiosity
- Open mind and listen
- Good sense of relationship and ability to integrate and adapt to the group
Constraints and risks
Possibility, in the context of carrying out experiments in installations for the use of X-rays (even while on the move), of working outside normal working hours (weekend and/or nights).
The research will be conducted in English or French, but it is expected that the non-French-speaking candidate will try to learn the basics of French in order to facilitate communication and its integration into the laboratory.
Remuneration and benefits
Remuneration
The remuneration is a minimum of 2300,00 € monthly
Annual leave and TWU
44 days
Practice and compensation of TT
TT practice and compensation
Transport
Support at 75% cost and sustainable mobility package up to 300€
About the offer
Supply Reference UMR5075-VALLAN-057 Section(s) CN / Research Area Molecular and structural biology, biochemistryAbout CNRS
The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. His unique position as a multi-specialist allows him to associate the different disciplines in order to face the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.
The CNRS
Research occupations
Machine translation (OPUS-MT) — the original text is authoritative
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Description du Poste
Sujet De Thèse
Les méthodes de diffusion et de diffraction des rayons X résolues en temps ont révolutionné la biologie structurale, en mettant en lumière la dynamique structurale qui accompagne des fonctions biologiques essentielles. Le doctorant utilisera la diffusion statique et résolue en temps des rayons X en solution pour suivre les changements structuraux des photoswitches à base d’ADN azobenzène-G-quadruplex (AzO-G4) après excitation par la lumière, révélant ainsi les variations de volume induites par la photoisomérisation de l’azobenzène et apportant un éclairage sur la dynamique et la hiérarchie structurelle des changements conformationnels de l’AzO-G4.
Votre Environnement de Travail
Situé sur le Polygone scientifique de Grenoble (ESRF/ILL/EMBL/IBS), l’Institut de Biologie Structurale (IBS) est un acteur d’envergure nationale et internationale dans le domaine de la biologie structurale intégrée. A la fois centre de recherche, plateau technique, site d'accueil et de formation scientifique, l'IBS a pour vocation le développement de recherches en biologie structurale, un champ de recherche capital pour la compréhension des mécanismes biologiques fondamentaux. Il s’appuie sur 12 plateformes à la pointe de la technologie.
En tant qu’unité mixte de recherche (CEA-CNRS-UGA) l’IBS est composé de 20 groupes de recherche, chacun de ces groupes proposant une approche multi-disciplinaire, aux frontières de la biologie, de la physique et de la chimie, en cohérence avec 3 axes de recherche. Près de 320 personnes y travaillent : chercheurs, doctorants, ingénieurs et techniciens dans un environnement multiculturel et international.
La personne recrutée intégrera le groupe Dynamop qui se focalise sur l’étude de la dynamique structurale des macromolécules biologiques :
https://www.ibs.fr/en/research/assembly-dynamics-and-reactivity/dynamics-and-kinetics-of-molecular-processes-group-m-weik/?lang=en
Activités :
- Préparer des échantillons de AzO-G4 en solution
- Participer à des expériences de diffusion de rayons X résolue en temps
- Analyser et interpréter des données expérimentales
- Modéliser les données expérimentales par simulations de dynamique moléculaire
- Mettre en forme les résultats pour des rapports et des présentations orales en anglais
- Être force de proposition pour la mise au point et l’amélioration des expériences
- Rédiger en anglais des protocoles et des articles de recherche pour la publication des travaux réalisés
- Participer à la vie en commun du groupe de recherche
- Aider à la supervision de stagiaires
- Participer aux événements scientifiques de l’Institut
Compétences :
- compétences en biophysique ou physique de la matière molle
- notions de biochimie des molécules biologiques
- maîtrise d’outils d’analyse de données expérimentales
- connaissance d’un langage de programmation (Python, C++, etc.)
- Anglais (écrit/oral) niveau B2
- Capacité d’autonomie
- Pro-activité dans la recherche, curiosité scientifique
- Ouverture d’esprit et écoute
- Bon sens du relationnel et capacité d’intégration et d’adaptation au groupe
Contraintes et risques
Possibilité, dans le cadre de réalisation d’expériences dans des installations pour l'utilisation de rayons X (même en déplacement), de travail hors horaire normal (week-end et / ou nuits).
La recherche se fera indifféremment en français ou anglais, néanmoins il est attendu que le candidat non-francophone s'efforce d'apprendre les bases du français afin de faciliter la communication et son intégration dans le laboratoire.
Rémunération et avantages
Rémunération
La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
Référence de l’offre UMR5075-VALLAN-057 Section(s) CN / Domaine de recherche Biologie moléculaire et structurale, biochimieÀ propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
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