researchJobsPhD Contract
Contrat doctoral — Machine-translated title
From the ad
Description of the post
Subject of Thesis
Hyperaccumulation of vanadium in sponge holobionts: bacterial contribution and physiological role.
Your Working Environment
The hyperaccumulation of the metal element vanadium (V) has recently been shown in two homoscleromorphic sponges. The objectives of the thesis are 1) to determine whether bacterial communities are themselves affected by hyperaccumulation and/or involved in the process (metabolic pathways), 2) what is the physiological role of this hyperaccumulation, 3) to participate in the study of molecular mechanisms? and 4) assess the possibility of using these holobionts to sequester V for bioremediation or recycling. The thesis project is part of a larger project funded by ANR involving four laboratories; the study implemented will therefore be based on an integrative approach.
MISSIONS
The PhD student will have to be involved in the preparation of biological samples and experimentally in the various techniques used to meet the previous objectives (bioinformatics, physiology, chemistry, cell biology: an integrative approach from molecule to ecosystem). It will have to ensure a bibliographical monitoring and present its results to the consortium on a regular basis. He/she will have to co-author articles from his/her work, present his/her results at congresses and write his/her thesis manuscript.
ACTIVITIES
- Separate bacteria from hyperaccumulative sponge cells by flow cytometry and then evaluate by ICPMS if symbiotes also accumulate vanadium
- Compare by metabarcoding if bacterial communities are different between close hyperaccumulative and non-hyperaccumulative species, if necessary determine possible bacterial families likely to be involved in this mechanism.
- Participate in characterization of the expression of candidate genes or in the location of proteins potentially in the hyperaccumulation mechanism
- Compare V levels between individuals exposed or not exposed to V
- Compare tolerance to oxic stress of accumulating and non-accumulative species
- Compare chemical compounds emitted by accumulating and non-accumulative species
SKILLS
- Strong involvement in the project
- Rigor, scientific honesty, perseverance
- Communication and editorial in English and French
- Adaptive capacity
- Solid bases in molecular, cellular, physiology biology: necessary practical experience
- Environmental chemistry, microbiology and statistics
- Basics in bioinformatics and metabarcoding
- Knowledge of porifers
Constraints and risks
Travel between the laboratories involved (LCB, IMBE, CEREGE, BIAM): Recommended B permit.
Exceptional work on weekends or evenings
Travel abroad to attend international conferences
Remuneration and benefits
Remuneration
2300€
Annual leave and TWU
44 days
Practice and compensation of TT
TT practice and compensation
Transport
Support at 75% cost and sustainable mobility package up to 300€
About the offer
Supply Reference UMR7263-KHEBOU-063 Section(s) CN / Research Area Biodiversity, biological evolution and adaptation: from macromolecules to communitiesAbout CNRS
The CNRS is a major player in fundamental research on a global scale. The CNRS is the only French organization active in all scientific fields. His unique position as a multi-specialist allows him to associate the different disciplines in order to face the most important challenges of the contemporary world, in connection with the actors of change.
The CNRS
Research occupations
Machine translation (OPUS-MT) — the original text is authoritative
Show the original advertisement
Description du Poste
Sujet De Thèse
Hyper accumulation du vanadium chez les holobiontes d’éponges : contribution bactérienne et rôle physiologique.
Votre Environnement de Travail
L’hyper accumulation de l’élément métallique vanadium (V) a été montrée récemment chez deux éponges homoscléromorphes. Les objectifs de la thèse visent 1) à déterminer si les communautés bactériennes sont concernées elles-mêmes par l’hyper accumulation et/ou impliquées dans le processus (voies métaboliques), 2) quel est le rôle physiologique de cette hyper-accumulation, 3) participer à l’étude des mécanismes moléculaires ? impliqués et 4) évaluer la possibilité d’utiliser ces holobiontes pour séquestrer du V à des fins de biorémédiation ou recyclage. Le projet de thèse s’inscrit dans un projet plus large financé par l’ANR qui implique quatre laboratoires ; l’étude mise en œuvre s’appuiera donc sur une approche intégrative.
MISSIONS
Le doctorant devra s’impliquer dans la préparation des échantillons biologiques et expérimentalement dans les différentes techniques mises en œuvre pour répondre aux objectifs précédents (bioinformatique, physiologie, chimie, biologie cellulaire : approche intégrative de la molécule à l’écosystème). Il devra assurer une veille bibliographique et présenter régulièrement à l’oral ses résultats devant le consortium. Il/elle devra rédiger en collaboration les articles issus de ses travaux, présenter ses résultats lors de congrès et rédiger son manuscrit de thèse.
ACTIVITÉS
- Séparer les bactéries des cellules d’éponges hyper accumulatrices par cytométrie en flux puis évaluer par ICPMS si les symbiotes accumulent également le vanadium
- Comparer par metabarcoding si les communautés bactériennes sont différentes entre espèces proches hyper accumulatrices et non hyper accumulatrices, le cas échéant déterminer d’éventuelles familles bactériennes susceptibles d’être impliquées dans ce mécanisme.
- Participer à la caractérisation de l’expression des gènes candidats ou à la localisation des protéines potentiellement dans le mécanisme d’hyperaccumulation
- Comparer les teneurs de V entre individus exposés ou non au V
- Comparer la tolérance au stress oxique des espèces accumulatrices et non accumulatrices
- Comparer les composés chimiques émis par les espèces accumulatrices et non accumulatrices
COMPÉTENCES
- Implication forte dans le projet
- Rigueur, honnêteté scientifique, persévérance
- Communication et rédactionnelle en français et en anglais
- Capacités d’adaptation
- Bases solides en biologie moléculaire, cellulaire, physiologie : expérience pratique nécessaire
- Bases de chimie environnementale, microbiologie et statistiques
- Bases en bioinformatique et métabarcoding
- Connaissance des porifères
Contraintes et risques
Déplacements à prévoir entre les laboratoires impliqués (LCB, IMBE, CEREGE, BIAM) : permis B recommandé.
Travail exceptionnel le week-end ou en soirée
Déplacements à l’étranger pour assister à des conférences internationales
Rémunération et avantages
Rémunération
2300€
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Transport
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
À propos de l’offre
Référence de l’offre UMR7263-KHEBOU-063 Section(s) CN / Domaine de recherche Biodiversité, évolution et adaptations biologiques : des macromolécules aux communautésÀ propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
Le CNRS
Les métiers de la recherche
Advertisement text from CNRS, no licence stated; reproduced with attribution.
The employer's ad is the binding version. Apply through their system.
?
Saved calls and ads appear on your calendar, and their deadlines are included when you export it. Nothing else is added for you.